Die Klostergebäude wurde ab 1722 von Grund auf neu errichtet. Nach vorangegangener Säkularisierung (1803) wurde das Kloster 1901 erneut zur Abtei erhoben. Es zählt zu den ältesten bestehenden deutschsprachigen Frauenklöstern nördlich der Alpen.

Das Frauenwörther Münster ist eines der ältesten kirchlichen Großbauten Süddeutschlands. Einzigartig sind unter anderem romanische Fresken, die in den 1960er Jahren auf dem Dachboden der Kirche freigelegt wurden, sowie fünf Engelsfresken der anliegenden Michaelskapelle.